단일세포 공간 전사체학 데이터셋의 세포 간 통신 네트워크 추론을 위한 그래프 이론적 접근법

단일세포 공간 전사체학 데이터는 세포의 위치 정보를 포함하여 유전자 발현 패턴을 제공하며, 이를 통해 세포 간의 잠재적인 상호작용 네트워크를 구축할 수 있습니다.

네트워크 추론 방법론

• 세포 유형 분류 및 클러스터링을 기반으로 관심 있는 세포 쌍을 식별합니다.
• 두 세포 간의 유전자 발현 유사성 또는 특정 신호 분자(예: 리간드)의 공동 발현 정도를 측정하여 연결 강도를 정의합니다.
• 측정된 연결 강도를 이용하여 그래프 이론 기반의 알고리즘(예: 커뮤니티 탐지)을 적용함으로써 실제 세포 간 통신 네트워크의 구조적 특징을 추론합니다.

이러한 접근법은 공간 전사체학 데이터에서 숨겨진 세포 간의 기능적 관계망을 밝히는 데 필수적이며, 이는 시스템 생물학적 해석을 가능하게 합니다.